Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TchpQ3TVW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TchpQ3TVW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TchpQ3TVW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TchpQ3TVW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TchpQ3TVW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TchpQ3TVW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TchpQ3TVW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms