Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt2Q3TTY5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt2Q3TTY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt2Q3TTY5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt2Q3TTY5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt2Q3TTY5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt2Q3TTY5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt2Q3TTY5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt2Q3TTY5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt2Q3TTY5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt2Q3TTY5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms