Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim43aQ3TL54 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim43aQ3TL54 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim43aQ3TL54 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim43aQ3TL54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim43aQ3TL54 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim43aQ3TL54 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43aQ3TL54 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms