Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Patl1Q3TC46 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl1Q3TC46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl1Q3TC46 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Patl1Q3TC46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Patl1Q3TC46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Patl1Q3TC46 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms