Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd2bQ3T9M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd2bQ3T9M1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd2bQ3T9M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd2bQ3T9M1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd2bQ3T9M1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd2bQ3T9M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms