Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxi2Q3I5G5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxi2Q3I5G5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxi2Q3I5G5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxi2Q3I5G5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms