Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd3Q14AI6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd3Q14AI6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd3Q14AI6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd3Q14AI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms