Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc138Q0VF22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc138Q0VF22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc138Q0VF22 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc138Q0VF22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc138Q0VF22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms