Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisal1Q0VBP7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal1Q0VBP7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisal1Q0VBP7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Shisal1Q0VBP7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms