Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
StumQ0VBF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
StumQ0VBF8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
StumQ0VBF8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
StumQ0VBF8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
StumQ0VBF8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
StumQ0VBF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms