Protein–RNA interactions for Protein: Q0EEE2

Ptchd3, Patched domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd3Q0EEE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptchd3Q0EEE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptchd3Q0EEE2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptchd3Q0EEE2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptchd3Q0EEE2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptchd3Q0EEE2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptchd3Q0EEE2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms