Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tie1Q06806 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tie1Q06806 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tie1Q06806 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tie1Q06806 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tie1Q06806 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tie1Q06806 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tie1Q06806 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tie1Q06806 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tie1Q06806 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms