Protein–RNA interactions for Protein: P99025

Gchfr, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GchfrP99025 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GchfrP99025 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GchfrP99025 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GchfrP99025 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GchfrP99025 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GchfrP99025 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GchfrP99025 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GchfrP99025 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GchfrP99025 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GchfrP99025 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GchfrP99025 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GchfrP99025 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GchfrP99025 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GchfrP99025 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GchfrP99025 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GchfrP99025 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GchfrP99025 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GchfrP99025 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GchfrP99025 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GchfrP99025 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GchfrP99025 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms