Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis3P97368 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Meis3P97368 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis3P97368 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Meis3P97368 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Meis3P97368 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis3P97368 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Meis3P97368 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Meis3P97368 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Meis3P97368 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Meis3P97368 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Meis3P97368 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Meis3P97368 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Meis3P97368 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Meis3P97368 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Meis3P97368 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms