Protein–RNA interactions for Protein: P84750

Ig kappa chain V region Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84750 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P84750 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P84750 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P84750 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P84750 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P84750 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P84750 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P84750 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P84750 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P84750 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P84750 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P84750 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P84750 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P84750 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P84750 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P84750 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P84750 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P84750 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P84750 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P84750 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P84750 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P84750 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P84750 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P84750 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P84750 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P84750 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P84750 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P84750 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P84750 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P84750 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P84750 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P84750 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P84750 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P84750 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P84750 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P84750 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P84750 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P84750 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P84750 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P84750 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P84750 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P84750 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P84750 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P84750 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P84750 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P84750 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P84750 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P84750 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P84750 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P84750 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P84750 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P84750 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P84750 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P84750 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P84750 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P84750 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P84750 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P84750 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P84750 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P84750 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P84750 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P84750 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P84750 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P84750 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P84750 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P84750 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P84750 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P84750 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P84750 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P84750 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P84750 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P84750 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P84750 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P84750 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P84750 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P84750 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P84750 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P84750 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P84750 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P84750 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P84750 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms