Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpcaP84075 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpcaP84075 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HpcaP84075 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpcaP84075 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HpcaP84075 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HpcaP84075 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HpcaP84075 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpcaP84075 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HpcaP84075 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HpcaP84075 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HpcaP84075 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HpcaP84075 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HpcaP84075 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpcaP84075 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HpcaP84075 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HpcaP84075 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms