Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpl31P62900 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl31P62900 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl31P62900 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl31P62900 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl31P62900 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms