Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab1AP62821 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab1AP62821 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab1AP62821 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab1AP62821 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab1AP62821 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab1AP62821 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rab1AP62821 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab1AP62821 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab1AP62821 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab1AP62821 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab1AP62821 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab1AP62821 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab1AP62821 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab1AP62821 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab1AP62821 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab1AP62821 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab1AP62821 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms