Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm3P62311 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm3P62311 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm3P62311 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm3P62311 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm3P62311 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms