Protein–RNA interactions for Protein: P56845

Tcl1b5, Protein TCL1B5, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b5P56845 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcl1b5P56845 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcl1b5P56845 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcl1b5P56845 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcl1b5P56845 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tcl1b5P56845 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms