Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc1a3P56564 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc1a3P56564 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a3P56564 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc1a3P56564 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc1a3P56564 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc1a3P56564 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms