Protein–RNA interactions for Protein: P51437

Camp, Cathelicidin antimicrobial peptide, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CampP51437 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CampP51437 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CampP51437 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CampP51437 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CampP51437 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CampP51437 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CampP51437 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CampP51437 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CampP51437 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CampP51437 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CampP51437 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CampP51437 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CampP51437 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CampP51437 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CampP51437 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CampP51437 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CampP51437 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CampP51437 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CampP51437 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CampP51437 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CampP51437 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CampP51437 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CampP51437 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CampP51437 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CampP51437 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CampP51437 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CampP51437 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CampP51437 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CampP51437 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CampP51437 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CampP51437 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CampP51437 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CampP51437 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CampP51437 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CampP51437 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CampP51437 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CampP51437 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CampP51437 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CampP51437 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CampP51437 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CampP51437 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CampP51437 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CampP51437 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CampP51437 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CampP51437 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CampP51437 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CampP51437 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CampP51437 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CampP51437 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CampP51437 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CampP51437 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CampP51437 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CampP51437 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CampP51437 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CampP51437 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CampP51437 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CampP51437 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CampP51437 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CampP51437 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CampP51437 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CampP51437 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CampP51437 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CampP51437 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CampP51437 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CampP51437 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CampP51437 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CampP51437 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CampP51437 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CampP51437 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CampP51437 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CampP51437 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CampP51437 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CampP51437 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CampP51437 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CampP51437 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CampP51437 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CampP51437 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CampP51437 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CampP51437 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CampP51437 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CampP51437 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CampP51437 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CampP51437 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CampP51437 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CampP51437 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CampP51437 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CampP51437 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CampP51437 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CampP51437 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CampP51437 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CampP51437 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms