Protein–RNA interactions for Protein: P48453

Ppp3cb, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3cbP48453 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3cbP48453 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3cbP48453 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3cbP48453 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3cbP48453 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp3cbP48453 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp3cbP48453 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp3cbP48453 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp3cbP48453 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp3cbP48453 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp3cbP48453 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp3cbP48453 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms