Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli1P47806 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli1P47806 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli1P47806 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli1P47806 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli1P47806 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli1P47806 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli1P47806 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli1P47806 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli1P47806 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli1P47806 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli1P47806 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli1P47806 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli1P47806 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli1P47806 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli1P47806 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli1P47806 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli1P47806 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli1P47806 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gli1P47806 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms