Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capza1P47753 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza1P47753 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza1P47753 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza1P47753 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza1P47753 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza1P47753 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza1P47753 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capza1P47753 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Capza1P47753 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza1P47753 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza1P47753 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Capza1P47753 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza1P47753 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capza1P47753 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza1P47753 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza1P47753 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza1P47753 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza1P47753 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza1P47753 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza1P47753 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza1P47753 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza1P47753 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza1P47753 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza1P47753 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza1P47753 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza1P47753 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms