Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf2P39429 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf2P39429 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf2P39429 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf2P39429 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf2P39429 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf2P39429 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf2P39429 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf2P39429 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf2P39429 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf2P39429 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf2P39429 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf2P39429 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf2P39429 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf2P39429 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf2P39429 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf2P39429 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf2P39429 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf2P39429 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf2P39429 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf2P39429 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf2P39429 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms