Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TtlP38585 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TtlP38585 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TtlP38585 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TtlP38585 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TtlP38585 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TtlP38585 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TtlP38585 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TtlP38585 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TtlP38585 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TtlP38585 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TtlP38585 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TtlP38585 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TtlP38585 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TtlP38585 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TtlP38585 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TtlP38585 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TtlP38585 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TtlP38585 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TtlP38585 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TtlP38585 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TtlP38585 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TtlP38585 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TtlP38585 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TtlP38585 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TtlP38585 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TtlP38585 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TtlP38585 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TtlP38585 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TtlP38585 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TtlP38585 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TtlP38585 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TtlP38585 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TtlP38585 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TtlP38585 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TtlP38585 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TtlP38585 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TtlP38585 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TtlP38585 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TtlP38585 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TtlP38585 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TtlP38585 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TtlP38585 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TtlP38585 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TtlP38585 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TtlP38585 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TtlP38585 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TtlP38585 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TtlP38585 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TtlP38585 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TtlP38585 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TtlP38585 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TtlP38585 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TtlP38585 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TtlP38585 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TtlP38585 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TtlP38585 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TtlP38585 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TtlP38585 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TtlP38585 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TtlP38585 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TtlP38585 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TtlP38585 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TtlP38585 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TtlP38585 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TtlP38585 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TtlP38585 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TtlP38585 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TtlP38585 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TtlP38585 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TtlP38585 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TtlP38585 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TtlP38585 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TtlP38585 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TtlP38585 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TtlP38585 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TtlP38585 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TtlP38585 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TtlP38585 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TtlP38585 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TtlP38585 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TtlP38585 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TtlP38585 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TtlP38585 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TtlP38585 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TtlP38585 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TtlP38585 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TtlP38585 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TtlP38585 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TtlP38585 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TtlP38585 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TtlP38585 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TtlP38585 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TtlP38585 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TtlP38585 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TtlP38585 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TtlP38585 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TtlP38585 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TtlP38585 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TtlP38585 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms