Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab17P35292 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab17P35292 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab17P35292 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab17P35292 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab17P35292 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab17P35292 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab17P35292 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab17P35292 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab17P35292 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms