Protein–RNA interactions for Protein: P31650

Slc6a11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a11P31650 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a11P31650 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a11P31650 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a11P31650 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a11P31650 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc6a11P31650 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a11P31650 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms