Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cbx2P30658 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cbx2P30658 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cbx2P30658 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cbx2P30658 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cbx2P30658 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cbx2P30658 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cbx2P30658 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cbx2P30658 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cbx2P30658 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cbx2P30658 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cbx2P30658 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms