Protein–RNA interactions for Protein: P24860

Ccnb1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1P24860 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnb1P24860 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnb1P24860 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccnb1P24860 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnb1P24860 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnb1P24860 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnb1P24860 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Ccnb1P24860 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnb1P24860 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnb1P24860 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccnb1P24860 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnb1P24860 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms