Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aldh1a1P24549 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Aldh1a1P24549 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aldh1a1P24549 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aldh1a1P24549 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Aldh1a1P24549 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Aldh1a1P24549 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Aldh1a1P24549 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Aldh1a1P24549 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aldh1a1P24549 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aldh1a1P24549 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Aldh1a1P24549 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aldh1a1P24549 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Aldh1a1P24549 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms