Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f1P21952 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f1P21952 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f1P21952 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pou3f1P21952 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou3f1P21952 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou3f1P21952 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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