Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP20293 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TP20293 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP20293 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP20293 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP20293 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP20293 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP20293 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP20293 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP20293 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP20293 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TP20293 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP20293 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP20293 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP20293 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP20293 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP20293 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP20293 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP20293 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP20293 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP20293 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP20293 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TP20293 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TP20293 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP20293 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP20293 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP20293 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TP20293 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TP20293 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TP20293 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP20293 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP20293 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP20293 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP20293 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP20293 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP20293 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP20293 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP20293 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP20293 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP20293 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TP20293 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP20293 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TP20293 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP20293 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP20293 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TP20293 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP20293 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP20293 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP20293 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP20293 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP20293 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP20293 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP20293 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP20293 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP20293 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP20293 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP20293 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP20293 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP20293 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP20293 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP20293 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP20293 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP20293 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP20293 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP20293 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP20293 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP20293 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP20293 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TP20293 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TP20293 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TP20293 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TP20293 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP20293 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TP20293 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP20293 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP20293 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP20293 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP20293 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP20293 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP20293 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP20293 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP20293 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP20293 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP20293 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP20293 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms