Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PdgfaP20033 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PdgfaP20033 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfaP20033 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdgfaP20033 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfaP20033 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms