Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Dnmt1P13864 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Dnmt1P13864 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Dnmt1P13864 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Dnmt1P13864 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Dnmt1P13864 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Dnmt1P13864 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Dnmt1P13864 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Dnmt1P13864 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Dnmt1P13864 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Dnmt1P13864 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Dnmt1P13864 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Dnmt1P13864 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Dnmt1P13864 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Dnmt1P13864 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Dnmt1P13864 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Dnmt1P13864 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Dnmt1P13864 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Dnmt1P13864 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Dnmt1P13864 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Dnmt1P13864 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Dnmt1P13864 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Dnmt1P13864 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Dnmt1P13864 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Dnmt1P13864 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Dnmt1P13864 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Dnmt1P13864 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms