Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt8P11679 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt8P11679 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt8P11679 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt8P11679 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt8P11679 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt8P11679 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt8P11679 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt8P11679 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt8P11679 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt8P11679 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt8P11679 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt8P11679 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms