Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myod1P10085 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myod1P10085 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myod1P10085 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Myod1P10085 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myod1P10085 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myod1P10085 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myod1P10085 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myod1P10085 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myod1P10085 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myod1P10085 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Myod1P10085 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myod1P10085 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myod1P10085 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myod1P10085 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myod1P10085 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myod1P10085 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myod1P10085 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myod1P10085 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms