Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Becn2P0DM65 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Becn2P0DM65 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Becn2P0DM65 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Becn2P0DM65 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Becn2P0DM65 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Becn2P0DM65 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Becn2P0DM65 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms