Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gap43P06837 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gap43P06837 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gap43P06837 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gap43P06837 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gap43P06837 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gap43P06837 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gap43P06837 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gap43P06837 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gap43P06837 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gap43P06837 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gap43P06837 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gap43P06837 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gap43P06837 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gap43P06837 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gap43P06837 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms