Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3pxd2aO89032 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3pxd2aO89032 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3pxd2aO89032 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3pxd2aO89032 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3pxd2aO89032 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms