Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SlkO54988 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SlkO54988 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SlkO54988 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SlkO54988 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SlkO54988 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SlkO54988 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SlkO54988 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SlkO54988 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SlkO54988 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SlkO54988 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SlkO54988 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SlkO54988 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SlkO54988 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SlkO54988 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SlkO54988 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SlkO54988 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SlkO54988 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SlkO54988 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SlkO54988 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SlkO54988 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SlkO54988 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SlkO54988 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SlkO54988 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SlkO54988 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SlkO54988 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SlkO54988 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SlkO54988 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SlkO54988 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SlkO54988 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SlkO54988 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SlkO54988 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SlkO54988 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SlkO54988 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SlkO54988 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SlkO54988 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SlkO54988 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SlkO54988 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SlkO54988 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SlkO54988 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SlkO54988 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SlkO54988 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SlkO54988 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SlkO54988 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SlkO54988 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SlkO54988 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SlkO54988 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SlkO54988 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SlkO54988 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SlkO54988 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SlkO54988 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SlkO54988 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SlkO54988 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SlkO54988 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SlkO54988 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SlkO54988 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SlkO54988 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SlkO54988 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SlkO54988 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SlkO54988 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SlkO54988 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SlkO54988 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SlkO54988 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SlkO54988 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SlkO54988 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SlkO54988 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SlkO54988 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SlkO54988 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SlkO54988 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SlkO54988 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SlkO54988 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SlkO54988 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SlkO54988 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SlkO54988 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SlkO54988 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SlkO54988 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SlkO54988 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SlkO54988 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SlkO54988 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SlkO54988 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SlkO54988 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SlkO54988 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SlkO54988 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SlkO54988 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SlkO54988 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SlkO54988 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SlkO54988 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SlkO54988 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SlkO54988 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SlkO54988 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SlkO54988 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SlkO54988 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SlkO54988 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SlkO54988 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms