Protein–RNA interactions for Protein: O54984

Asna1, ATPase Asna1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asna1O54984 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Asna1O54984 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Asna1O54984 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Asna1O54984 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asna1O54984 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Asna1O54984 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Asna1O54984 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asna1O54984 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Asna1O54984 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Asna1O54984 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asna1O54984 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asna1O54984 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Asna1O54984 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asna1O54984 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asna1O54984 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Asna1O54984 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asna1O54984 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asna1O54984 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asna1O54984 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asna1O54984 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms