Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kif3cO35066 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kif3cO35066 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kif3cO35066 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kif3cO35066 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif3cO35066 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3cO35066 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms