Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps1O08983 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps1O08983 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps1O08983 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps1O08983 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps1O08983 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hps1O08983 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps1O08983 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps1O08983 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps1O08983 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps1O08983 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps1O08983 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps1O08983 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps1O08983 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps1O08983 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps1O08983 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms