Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn5O08688 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn5O08688 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn5O08688 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn5O08688 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn5O08688 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn5O08688 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn5O08688 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn5O08688 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn5O08688 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn5O08688 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn5O08688 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn5O08688 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn5O08688 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn5O08688 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn5O08688 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn5O08688 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn5O08688 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn5O08688 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn5O08688 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms