Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ascl4M0QW46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ascl4M0QW46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ascl4M0QW46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl4M0QW46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.9 ms