Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8050L7N2E3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8050L7N2E3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8050L7N2E3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8050L7N2E3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8050L7N2E3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8050L7N2E3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8050L7N2E3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8050L7N2E3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8050L7N2E3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms