Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3239L7N2D9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3239L7N2D9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3239L7N2D9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3239L7N2D9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3239L7N2D9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.8 ms