Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8720K9J7F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8720K9J7F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8720K9J7F4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8720K9J7F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm8720K9J7F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8720K9J7F4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8720K9J7F4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8720K9J7F4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8720K9J7F4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms